Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAIPQ9BWF2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms