Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
HIRIP3Q9BW71 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms