Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms