Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCM2Q9BSQ5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCM2Q9BSQ5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCM2Q9BSQ5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCM2Q9BSQ5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 819.8 ms