Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERP44Q9BS26 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms