Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms