Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MEIS3Q99687 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms