Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHOX2BQ99453 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHOX2BQ99453 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHOX2BQ99453 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHOX2BQ99453 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHOX2BQ99453 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHOX2BQ99453 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHOX2BQ99453 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHOX2BQ99453 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHOX2BQ99453 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHOX2BQ99453 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHOX2BQ99453 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHOX2BQ99453 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHOX2BQ99453 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHOX2BQ99453 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHOX2BQ99453 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHOX2BQ99453 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHOX2BQ99453 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms