Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms