Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP3Q96P47 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms