Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms