Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf85Q96MD7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms