Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PRRC1Q96M27 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms