Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAMP1Q96JM3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms