Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN17Q96FV3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN17Q96FV3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms