Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms