Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELP4Q96EB1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELP4Q96EB1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELP4Q96EB1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELP4Q96EB1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELP4Q96EB1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELP4Q96EB1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELP4Q96EB1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELP4Q96EB1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELP4Q96EB1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELP4Q96EB1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELP4Q96EB1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELP4Q96EB1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELP4Q96EB1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELP4Q96EB1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELP4Q96EB1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELP4Q96EB1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELP4Q96EB1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELP4Q96EB1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms