Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHISA4Q96DD7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHISA4Q96DD7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms