Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB5

C8orf44, Putative uncharacterized protein C8orf44, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf44Q96CB5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf44Q96CB5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf44Q96CB5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf44Q96CB5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf44Q96CB5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf44Q96CB5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf44Q96CB5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf44Q96CB5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf44Q96CB5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf44Q96CB5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf44Q96CB5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms