Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms