Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms