Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKL2Q92772 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL2Q92772 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms