Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSC1Q92574 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms