Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATRIPQ8WXE1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms