Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE1Q8WV22 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE1Q8WV22 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms