Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WHAMMQ8TF30 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
WHAMMQ8TF30 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
WHAMMQ8TF30 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WHAMMQ8TF30 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
WHAMMQ8TF30 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WHAMMQ8TF30 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WHAMMQ8TF30 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WHAMMQ8TF30 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WHAMMQ8TF30 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms