Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT1Q8TDG2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms