Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM35BQ8NCS4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms