Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMTR1Q8N1G2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CMTR1Q8N1G2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms