Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR49Q8IV35 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms