Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms