Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALB2Q86YC2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALB2Q86YC2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms