Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SKAP1Q86WV1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKAP1Q86WV1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms