Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG4DQ86TL0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.7 ms