Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms