Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMS2Q7Z4I7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms