Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST3Q7LGC8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms