Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HECW1Q76N89 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms