Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM43BQ6ZT52 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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