Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC129Q6ZRS4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms