Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLCO4C1Q6ZQN7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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