Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms