Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms