Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms