Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC174Q6PII3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC174Q6PII3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC174Q6PII3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC174Q6PII3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC174Q6PII3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC174Q6PII3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC174Q6PII3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC174Q6PII3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC174Q6PII3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC174Q6PII3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC174Q6PII3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC174Q6PII3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC174Q6PII3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC174Q6PII3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC174Q6PII3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC174Q6PII3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms