Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLC3Q6P597 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLC3Q6P597 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLC3Q6P597 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLC3Q6P597 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLC3Q6P597 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLC3Q6P597 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLC3Q6P597 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLC3Q6P597 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLC3Q6P597 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLC3Q6P597 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLC3Q6P597 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLC3Q6P597 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLC3Q6P597 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLC3Q6P597 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLC3Q6P597 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLC3Q6P597 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLC3Q6P597 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLC3Q6P597 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KLC3Q6P597 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLC3Q6P597 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLC3Q6P597 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLC3Q6P597 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLC3Q6P597 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLC3Q6P597 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLC3Q6P597 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLC3Q6P597 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLC3Q6P597 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLC3Q6P597 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLC3Q6P597 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLC3Q6P597 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLC3Q6P597 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLC3Q6P597 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLC3Q6P597 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLC3Q6P597 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLC3Q6P597 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KLC3Q6P597 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLC3Q6P597 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLC3Q6P597 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLC3Q6P597 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLC3Q6P597 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLC3Q6P597 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLC3Q6P597 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLC3Q6P597 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
KLC3Q6P597 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
KLC3Q6P597 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLC3Q6P597 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLC3Q6P597 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
KLC3Q6P597 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLC3Q6P597 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms