Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGMBQ6NW40 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms