Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms