Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F0

DCAF12, DDB1- and CUL4-associated factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF12Q5T6F0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCAF12Q5T6F0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCAF12Q5T6F0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms