Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY00

TSGA10IP, Testis-specific protein 10-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA10IPQ3SY00 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSGA10IPQ3SY00 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSGA10IPQ3SY00 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSGA10IPQ3SY00 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSGA10IPQ3SY00 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSGA10IPQ3SY00 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSGA10IPQ3SY00 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSGA10IPQ3SY00 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSGA10IPQ3SY00 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TSGA10IPQ3SY00 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSGA10IPQ3SY00 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.7 ms